西南交通大学联合成都市第三人民医院和西部战区总医院（原成都军区总医院）于2014年7月成立医学院。2023年1月，经学校学科和学院优化调整后，原材料科学与工程学院生物医学工程系及生物医学工程专业调整至医学院。

医学院现有生物医学工程系、临床医学系、生物医学工程研究院。有生物医学工程本科专业、生物医学工程（工学和医学学位）和临床医学两个一级学科硕士点、材料与化工（生物医学工程）专业型硕士点、材料科学与工程（生物医学材料）一级学科博士点。医学院面向人民生命健康，开展跨学科医学研究，促进生物材料、医学信息、大数据和人工智能等与医学学科的交叉融合，打造先进医疗器械及纳米诊断和治疗药物科学研究基地及复合型高端人才培养基地。

医学院以高层次人才建设为重点，努力打造高水平师资队伍。现有专（兼）任教师 178人（含附属医院兼职研究生导师），其中正高级职称64人，博士生导师27人，副高级职称91人。现有双聘院士2名，国家杰青在内的国家级人才3人，省部级人才30余人，国际生物材料科学与工程联合会fellow 2人。

学院教学科研条件优良，拥有四川省功能材料国际合作基地、人工器官表面工程四川省高校重点实验室、分子医学实验平台、基因检测诊断实验平台、生物医学材料实验平台、肥胖与代谢实验中心等多个高水平研究平台。近5年承担了国家自然科学基金重点项目，国家重点研发计划课题等国家级和全军课题80余项，省部级项目200余项，发表SCI论文500余篇，ESI论文20余篇，获得授权发明专利150余项，荣获四川省科技进步一等奖和军队科技进步一等奖5项。

医学院生物医学工程研究院以生物材料和无源医疗器械为研究特色，形成了生物医学材料、微纳医学、组织工程、生物摩擦与传感等研究方向。现有教授14人(含国家级人才3人)，副教授（高级工程师）15人，建有人工器官表面工程四川省高校重点实验室、四川省功能材料国际合作基地等科研平台，拥有生物材料制备及加工、细胞相容性评价、体内生物学评价等先进设备，价值超3000余万元。近5年在Nature Communications、Science Advances、PNAS、Advanced Materials等期刊发表SCI论文450余篇。

西南交通大学附属医院成都市第三人民医院是集医疗、科研、教学、预防、保健和康复为一体的国家三级甲等综合性医院。拥有1个国家临床重点专科建设单位（心血管内科），6个省级重点学科（心血管内科、呼吸与危重症医学科、眼科、消化内科、神经内科、实验医学研究部），7个省级重点专科（麻醉科、普外科、肾脏内科、重症医学科、超声医学科、病理科、药学部），2个省临床重点专科（呼吸内科、重症医学科），31个市级重点学科，3个成都市高水平临床重点专科建设项目，23个市级医疗质量控制中心（居市级医院之首），附设成都市心血管病、神经疾病、呼吸健康、肿瘤和消化5个研究所。拥有西南地区领先的模拟医学教育培训中心，占地9000余平方米，集智能医学教育，智能医学考试、智能线上教育、临床思维培训、模拟医学教育转化，智能医学教育数字化等于一体，强力支撑临床医学学生培养与实践。

西南交通大学附属医院西部战区总医院是全军五大战区医院之一，是一所集医疗、教学、科研和健康管理于一体的大型综合性三级甲等医院。配备各类国际先进大型医疗设备总值达9亿元。有1个国家临床重点专科（普通外科），1个国家及全军临床药物试验基地，2个国家中医药管理重点学科专科（中医康复学重点学科、截瘫康复重点专科），5个国家和全军培训基地（国家卫健委耳鼻喉科内窥镜培训基地、国家卫健委脑卒中筛查与防治中心、国家ERCP技术标准化人才培训基地、全军心律失常介入培训基地、全军临床药师培训基地），1个全军医学重点实验室（全军热带医学重点实验室临床试验单元）、5个全军医学专科专病中心（普通外科中心、脑肿瘤微创中心、肝病诊治中心、神经外科麻醉中心、截瘫诊治康复中心）、5个四川省甲级重点学科。

医学院正勠力同心，砥砺奋进，扎实推进特色鲜明、国内有影响的一流研究型学院建设。